Sufrió varias lesiones que le tuvieron, en total, cerca de dos meses apartado de las canchas, camiseta usa basket y que le impidieron contar con la continuidad de juego necesaria. Pocos días antes de que el cierre patronal se levantara el 26 de noviembre, Lin había estado cerca de firmar con un club en Italia. Aranzana, de que equipo guardas mejor recuerdo de los que has estado? El jugador explicó que como aún tenía contrato con los Golden State Warriors, no podría jugar en la CBA ya que esta liga solo admitía a jugadores de la NBA sin contrato. Yao Ming, estrella retirada de la NBA y presidente de los Shanghai Sharks, intentó sin éxito fichar a Lin para la siguiente temporada de la CBA. «Ninguno de los dos es un gran atleta, pero ambos somos efectivos y sabemos cómo jugar», señaló Lin. El jugador continuó mejorando su pick and roll, cómo manejarse ante jugadas defensivas como la doble marca o las trampas, y mejoró su técnica de tiro, especialmente su lanzamiento de tres puntos.
En la fase final de la liga ACB es eliminado sin llegar a semifinales tras perder dos de los cinco partidos disputados ante Morabanc Andorra y San Pablo Burgos. El Oracle Arena, tras 2.070 partidos se despide como cancha de los Warriors que se mudan a San Francisco. La NFL realiza partidos los sábados solamente en diciembre y enero, para evitar conflictos con el fútbol americano universitario de la NCAA, que se disputa de septiembre a noviembre. El 8 de noviembre en Toronto, los Raptors tuvieron la Noche de la Herencia Asiática para que coincidiera con la visita de Lin y los Warriors. NBA en el siguiente partido durante la «Asian Heritage Night» (Noche de la Herencia Asiática) en el Oracle Arena. A punto de cumplir 24 años, el pequeño de los Hernangómez lleva tres temporadas ya en la NBA. En el siguiente juego contra Los Angeles Lakers, los campeones defensores, Lin anotó sus primeros puntos en la NBA, repartió tres asistencias, y registró cuatro robos.
Además, promedió 6,9 rebotes, 5,9 asistencias y 2,2 robos de balón, y por primera vez en su carrera fue elegido en los mejores quintetos tanto de la liga como defensivo. Lin ayudó a los Bighorns a conseguir un récord de 2-0 en la exhibición con promedios de 21,5 puntos, 6,0 rebotes, 5,5 asistencias y 3,5 robos. En veinte juegos con los Bighorns promedió 18 puntos, 5,8 rebotes y 4,4 asistencias. Más de veinte miembros de la prensa china de Toronto cubrieron el juego. Debido al cierre patronal los entrenadores no tuvieron muchas oportunidades para ver el juego de Lin y lo colocaron como el cuarto base en la rotación del equipo. Lin se recuperó de una lesión en el tendón rotuliano de la rodilla izquierda durante el cierre patronal de la NBA.
Debido al cierre patronal, no tuvo la oportunidad de practicar con el nuevo entrenador de los Warriors, Mark Jackson. El 3 de octubre se anuncia la contratación de Doc Rivers como entrenador principal, el cual acababa de ser cesado días atrás tras siete temporadas como entrenador de los Clippers. Lin dio crédito a Eric Musselman, el entrenador de los Bighorns, quien le «ayudó a recuperar la confianza». Lin comentó que estaba «compitiendo por un lugar en la reserva, y la gente me ve como el jugador entre la 12º y 15º posición del plantel. James es un sólido reboteador que regularmente aparece entre los mejores en este apartado del juego, pese a actuar en posiciones exteriores. Deportista Yugoslavo del año 2002 por el Comité Olímpico Nacional de Yugoslavia. La Liga de ese año fue una de las peores de las disputadas.